{"id":17141,"date":"2022-02-07T09:07:00","date_gmt":"2022-02-07T07:07:00","guid":{"rendered":"https:\/\/festibity.com\/general\/ithinkupc-i-lhospital-de-bellvitge\/"},"modified":"2026-01-23T14:19:54","modified_gmt":"2026-01-23T12:19:54","slug":"ithinkupc-i-lhospital-de-bellvitge","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/festibity.com\/es\/noticies-partner\/ithinkupc-i-lhospital-de-bellvitge\/","title":{"rendered":"IThinkUPC i l&#8217;Hospital de Bellvitge"},"content":{"rendered":"<p><em>Article escrit per \u00d2scar G\u00fcell d&#8217;IThinkUPC <\/em><\/p>\n<ul>\n<li><strong>Com donem suport bioinform\u00e0tic a un grup de recerca de l&#8217;Hospital de Bellvitge amb AWS<\/strong><\/li>\n<\/ul>\n<p class=\"rtejustify\">Als enginyers i enginyeres d\u2019<a href=\"https:\/\/www.ithinkupc.com\/ca\">IThinkUPC<\/a> ens motiva molt assessorar i facilitar als grups de recerca l\u2019acc\u00e9s a les eines inform\u00e0tiques m\u00e9s adients en cada cas particular, \u00e9s a dir, oferir-los la tecnologia que els permeti ser el m\u00e0xim d\u2019aut\u00f2noms i els ajudi a agilitzar els processos de recerca. La nostra vocaci\u00f3 \u00e9s oferir acompanyament expert, proper i flexible.<\/p>\n<p class=\"rtejustify\"><a href=\"https:\/\/www.youtube.com\/watch?v=_ThpXbRbQkA\">En aquest v\u00eddeo<\/a>, un grup de recerca del servei de microbiologia de l&#8217;Hospital de Bellvitge descriu com els hem ajudat a desplegar i gestionar un entorn d\u2019an\u00e0lisi bioinform\u00e0tica de dades amb eines de computaci\u00f3 al n\u00favol d\u2019Amazon Web Services. La Sara i l&#8217;Aida, del servei de microbiologia de l&#8217;Hospital de Bellvitge, ens ho expliquen a l&#8217;entrevista que podreu <a href=\"https:\/\/www.youtube.com\/watch?v=_ThpXbRbQkA\">escoltar al v\u00eddeo<\/a>. Us la transcrivim aqu\u00ed: <\/p>\n<p class=\"rtejustify\"><strong>Presentaci\u00f3 del grup: qui sou i a qu\u00e8 us dediqueu?<\/strong><\/p>\n<p class=\"rtejustify\">Som un grup de recerca del servei de microbiologia de l\u2019Hospital Universitari de Bellvitge que treballa en pat\u00f2gens bacterians, principalment pneumococ i <em>Haemophilus influenzae<\/em>. La nostra l\u00ednia de recerca se centra en l\u2019an\u00e0lisi de l\u2019ADN bacteri\u00e0 per veure com evoluciona en els pat\u00f2gens en el temps per\u00f2 tamb\u00e9 per estudiar-ne els mecanismes de virul\u00e8ncia i de resist\u00e8ncia antibi\u00f2tica.<\/p>\n<p class=\"rtejustify\"><strong>Com s\u2019ha vist afectada la vostra recerca amb la incorporaci\u00f3 de noves tecnologies?<\/strong><\/p>\n<p class=\"rtejustify\">La recerca epidemiol\u00f2gica ha canviat molt en els \u00faltims anys, ja que s\u2019han creat noves eines de seq\u00fcenciaci\u00f3 massiva m\u00e9s r\u00e0pides i fiables. Amb aquestes noves tecnologies podem aconseguir tota la informaci\u00f3 gen\u00e8tica dels microorganismes, per\u00f2 alhora generem moltes m\u00e9s dades i ens hem vist obligats a crear nous protocols d\u2019an\u00e0lisi bioinform\u00e0tica.<\/p>\n<p class=\"rtejustify\"><strong>Quines dificultats us heu trobat amb aquest canvi?<\/strong><\/p>\n<p class=\"rtejustify\">La principal dificultat que ens vam trobar va ser la manca d\u2019eines bioinform\u00e0tiques que s\u2019adaptessin a les nostres necessitats, com per exemple un entorn de treball Linux amb alta capacitat computacional per a les an\u00e0lisis i l\u2019espai d\u2019emmagatzematge.<\/p>\n<p class=\"rtejustify\"><strong>Quina soluci\u00f3 vau trobar?<\/strong><\/p>\n<p class=\"rtejustify\">Des de l\u2019hospital ens van posar en contacte amb l\u2019empresa de serveis TIC de la <a href=\"https:\/\/www.upc.edu\/ca\">Universitat Polit\u00e8cnica de Catalunya<\/a>, IThinkUPC, que compta amb consultors i consultores experts amb els quals de seguida ens vam entendre.<\/p>\n<p class=\"rtejustify\"><strong>Com treballeu amb IThinkUPC?<\/strong><\/p>\n<p class=\"rtejustify\">Despr\u00e9s de diverses reunions amb la Cristina, l\u2019Eduard i el D\u00eddac, van definir l\u2019arquitectura del servidor que s\u2019adapt\u00e9s millor a les nostres necessitats; van ser ells els que ens van suggerir que utilitz\u00e9ssim les eines de computaci\u00f3 al n\u00favol d\u2019Amazon Web Services.<\/p>\n<p class=\"rtejustify\">Ens van desplegar un entorn de treball amigable que ens permet treballar sense haver-nos de preocupar de la part m\u00e9s t\u00e8cnica. Actualment tenim un sistema d\u2019autogesti\u00f3 del servidor (RunDeck) i un altre que ens permet crear consultes i gestionar incid\u00e8ncies (GN6).<\/p>\n<p class=\"rtejustify\">RunDeck \u00e9s una p\u00e0gina web a la qual tenim acc\u00e9s mitjan\u00e7ant un usuari propi on tenim creades una s\u00e8rie de tasques que ens ajuden a gestionar el servidor. Per exemple, una d\u2019aquestes tasques ens permet iniciar i aturar el servidor, ja que a AWS es paga pel temps d\u2019\u00fas. Una altra tasca molt \u00fatil \u00e9s la consulta del consum mensual. A mesura que ens van sorgint noves necessitats, podem anar creant noves tasques.<\/p>\n<p class=\"rtejustify\">D\u2019altra banda, el GN6 \u00e9s un sistema de comunicaci\u00f3 directa amb l\u2019equip d\u2019IThinkUPC, que per exemple utilitzem si tenim problemes per instal\u00b7lar algun programa o si necessitem instal\u00b7lar alguna actualitzaci\u00f3, o simplement ens cal suport inform\u00e0tic.<\/p>\n<p class=\"rtejustify\"><strong>Recomanaries IThinkUPC a altres grups de recerca?<\/strong><\/p>\n<p class=\"rtejustify\">A nosaltres ens ha estat de gran ajuda rebre el suport d\u2019IThinkUPC, perqu\u00e8 al nostre grup no ten\u00edem els coneixements necessaris per desplegar i gestionar l\u2019entorn d\u2019an\u00e0lisi bioinform\u00e0tica de dades, i ara, en canvi, tenim l\u2019entorn i el suport quan els necessitem. Creiem que podria ser \u00fatil per als investigadors amb coneixements b\u00e0sics de Linux que necessiten dur a terme an\u00e0lisis bioinform\u00e0tiques de dades, per\u00f2 que no tenen la formaci\u00f3 per desplegar tot aquest sistema inform\u00e0tic.<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/www.ithinkupc.com\/ca\">Consulta la web d&#8217;IThinkUPC <\/a>| <a href=\"https:\/\/www.ithinkupc.com\/es\/blog\/como-damos-soporte-bioinformatico-a-un-grupo-de-investigacion-del-hospital-de-bellvitge-con-aws\">Lee este art\u00edculo en castellano<\/a> | <a href=\"https:\/\/www.youtube.com\/watch?v=_ThpXbRbQkA\">Mira el v\u00eddeo<\/a> <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Com donem suport bioinform\u00e0tic a un grup de recerca de l&#8217;Hospital de Bellvitge amb AWS<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":20083,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":"","_members_access_role":[],"_members_access_error":""},"categories":[35],"tags":[],"class_list":["post-17141","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-noticies-partner"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/festibity.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/17141","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/festibity.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/festibity.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/festibity.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/festibity.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=17141"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/festibity.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/17141\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":18045,"href":"https:\/\/festibity.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/17141\/revisions\/18045"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/festibity.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/20083"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/festibity.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=17141"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/festibity.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=17141"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/festibity.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=17141"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}